Sinopse: Se na primeira temporada o objetivo foi unir um grupo de pessoas comuns que, aos poucos, descobriam habilidades extraordinárias e tinham a missão de impedir a explosão de Peter Petrelli, a segunda teve o desafio de entrelaçar o caminho destes personagens, revelar o ponto fraco dos seus poderes, apresentar um novo vilão e, sobretudo, deixar bem claro que eles não são os únicos heróis da história. Mesmo depois do grande confronto, no céu de Nova Iorque, que resultou na explosão de Peter e Nathan Petrelli, pareceu ter dado fim aos antigos problemas, a vida dos mutantes nunca mais foi a mesma. Podemos dizer que ficou ainda mais agitada.

Hiro Nakamura ativa o seu poder durante a batalha contra Sylar e vai parar no Japão feudal do século XVII, onde encontra o fracassado samurai Takezu Kensei, a quem ajuda a desenvolver habilidades de guerreiro, ao revelar um grande vilão no corpo do imortal Adam Monroe. Noah Bennet deixa o Texas para viver em uma cidade da Califórnia, ele quer afastar sua família, principalmente Claire, das intenções de Bob Bishop, um antigo fundador da Companhia responsável pelas pesquisas do vírus fatal Shanti. A Companhia é formada pela primeira geração de heróis, cujos participantes são, além de Bob, o pai e a mãe de Peter e Nathan Petrelli, Kaito Nakamura, Adam Monroe, entre outros. Todos eles estão estampados em uma foto que será usada como instrumento de investigação. Peter Petrelli é encontrado desmemoriado dentro de um container, na Irlanda, e luta para recuperar a antiga forma. Nathan abandona a família, desiste da carreira política e, inacreditavelmente, vai procurar respostas sobre o seu poder e sobre os heróis. Matt Parkman tem uma batalha dura pela frente. Descobre que seu pai, além de pertencer a Companhia, é dono de um poder surpreendente, capaz de aprisioná-lo dentro de seus próprios pesadelos. Mohinder, que divide a guarda de Molly com Matt, se vê num dilema.

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(Festa de lançamento da 3ª temporada e Resumo das temporadas anteriores)

Episódio 00 - Especial Clip Show
Episódio 01 - The Second Coming
Episódio 02 - The Butterfly Effect
Episódio 03 -One of Us, One of Them
Episódio 04 - I am become death
Episódio 05 - Angels and Monsters
Episódio 06 - Dying of the Light
Episódio 07 - Eris Quod Sum
Episódio 08 - Villains
Episódio 09 - ‘It’s Coming’
Episódio 10 - The Eclipse,
Episódio 11 - The Eclipse, part 2
Episódio 12 - Our Father
Episódio 13 - Dual - Fim do Volume Três (LANÇAMENTO!)